Plus que toute autre activité économique, la filière « café » a construit la société et l’État kényan (21^ème producteur mondial). Aujourd’hui, bien que ce soit la culture du thé et l'horticulture (fleurs, légumes et fruits) qui se taillent la part du lion au sein du pays, le Kenya reste un acteur  important dans l’industrie mondiale du café.

Dans les années 1990, la crise mondiale du prix du café a entraîné le déclin rapide de la production de café qui, de plus de 100.000 tonnes, est tombée à environ 50.000 tonnes aujourd'hui. Les causes de ce déclin sont: 1) le coût élevé de la production (main-d'œuvre et des intrants), 2) la faible productivité due au vieillissement des caféiers, ce qui diminue la fertilité des sols et augmente la pression des ravageurs et des maladies, et 3) le manque de connaissance du marché et des compétences de marketing des coopératives agricoles pour contrer les prix bas offerts par les commerçants, en dépit de la réputation internationale de qualité du café kényan.

Malgré la baisse récente, la production de café reste la principale source de revenus pour environ un demi-million de petits exploitants qui ont moins de 2 ha de terres (70 % du café produit) et on estime que 6 millions de kényans vivent directement ou indirectement de l’industrie du café. Les principales régions de production de café sont les hauts plateaux au pied du mont Kenya, l’Aberdare Range, Kisii, Nyanza, Bungoma, Nakuru et Kericho. Dans ces régions, la taille des exploitations diminue rapidement en raison de la pression démographique (~ 200 habitants / km ²). En effet, la division des terres par héritage menace de rendre la culture du café non durable comme moyen de subsistance. Pour compenser la perte de recettes de café, les agriculteurs diversifient leurs productions et plantent de plus en plus de cultures vivrières (banane, maïs, haricot, choux, patate douce, manioc, igname, piment, tomate et potiron). Par conséquent, les systèmes agricoles sont très diverses, allant de monocultures de caféiers cultivés en plein soleil (avec quelques arbres de haies)  à des systèmes plus complexes avec des cultures vivrières associées à des caféiers et des arbres d'ombrage (y compris les arbres fruitiers).

Pour revigorer l'industrie du café, le gouvernement kényan a libéralisé le secteur par l'intermédiaire d'une nouvelle loi (Coffee Act), promulguée en 2006, ouvrant l'accès au marché international pour les producteurs. L'obligation de vendre aux enchères à la Bourse café de Nairobi a été supprimée et les ventes directes autorisées. Plusieurs bailleurs de fonds nationaux (Constituency Development Fund ...) et internationaux (Banque mondiale, Union européenne, Coopération suisse) ont soutenu cette initiative (projet UE QCPCP, Fondation Gates projet Technoserve). Récemment, le secteur privé a également commencé à investir dans de nouvelles usines à café efficaces dans la région et en favorisant l'élaboration de nouvelles normes de café, et de marque qui répondent aux critères du commerce équitable (UTZ, Rainforest, Nestlé ou Starbucks).

Un nouvel élan pour le seul secteur du café ne fera que contribuer partiellement à améliorer les conditions rencontrées par les petits agriculteurs d'aujourd'hui (par exemple répondre aux changements climatiques, à la disponibilité limitée des terres, à la diminution de fertilité des sols, au prix des intrants devenus inabordables, à la rareté du travail et l'augmentation des coûts de main-d'œuvre). Les agriculteurs dépendent de plus en plus sur la diversification des cultures (cultures vivrières, arbres fruitiers et de bois) pour essayer de maintenir ou d'améliorer leurs moyens de subsistance. Par conséquent, il y a un besoin de nouveaux systèmes agricoles garantissant la productivité des produits agricoles et la stabilité des revenus en mettant davantage l'accent sur la diversification du système, respectueuses de l'environnement des pratiques agricoles (y compris l'agroforesterie) ainsi que la qualité accrue de répondre aux demandes du marché.

Sur la base d'un partenariat entre l'Union des coopératives d'agriculteurs de Mugama (54 coopératives, soit plus de 120.000 agriculteurs) créée lors d'un précédent projet européen (Cafnet), la Coffee Research Foundation et l'ICRAF, le projet vise à développer et promouvoir les pratiques agroforestières pour améliorer la productivité agricole et la qualité du café et des autres produits agricoles (cultures vivrières, fruits, bois de feu, bois et autres produits) tout en améliorant la fourniture de services environnementaux (fertilité des sols, la régulation des ravageurs et des maladies, séquestration du carbone et la régulation de l'eau) aux niveaux des parcelles de culture et du paysage.